主人公（神奈川大学生）は自分でゲームを作り、毎年のゲームコンテストに参加してきた。
しかし、今年は「線形代数学」の試験日とゲームコンテストの日が重なってしまった。
線形代数の単位は、これ以上落とすことができない。
ゲームコンテストをあきらめざるを得ないが、勉強にも集中できない。
そんな彼が居眠りをしている間に、ゲームの世界に引きずり込まれる。
そして、その世界で自分が作ったゲームのキャラクターたちから、線形代数を教えてもらう。
1部では一国のお姫様から線形代数の基礎知識を、2部ではヒーロー省の役人から線形写像を、3部では国の支配を目論む野獣のゴードンさんから固有値を教えてもらう。
最後に、現実の世界に戻ってきた彼は何か不思議なことに気がつく。
それは…。